Dalam literatur sains, istilah kimia komputasi dan komputasi kimia kerap digunakan secara bergantian. Keduanya sama-sama merujuk pada pemanfaatan metode komputasi untuk memahami struktur, sifat, dan perilaku sistem kimia, mulai dari molekul sederhana hingga material yang lebih kompleks.
Meski demikian, ada nuansa penekanan yang sering membedakan keduanya dalam pemakaian sehari-hari. Kimia komputasi umumnya dipahami sebagai bidang kimia yang menggunakan model matematis dan perangkat komputasi untuk menjawab pertanyaan-pertanyaan kimia, sedangkan komputasi kimia lebih menonjolkan sisi metode, algoritma, dan implementasi komputasional yang mendukung kajian tersebut. Dengan kata lain, perbedaannya bukan pada objek studinya, melainkan pada sudut pandang yang dipakai.
